Hakan Bayrakçı, 1960 yılında İstanbul’da Mesut ve Seniha Bayrakçı çiftinin oğlu olarak doğmuştur. Baba tarafı Erzurum, anne tarafı İstanbulludur.
Saint Benoit ve Saint Michel Fransız kolejlerinde orta ve lise öğrenimini görmüştür. İstanbul Üniversitesi Tarih Bölümünden mezun olmuştur. 1982 – 1984 yılları arasında, ”Çadırlar”, ”Ortaçağ ve Türkler” ve ” Kırmızı Fırtına” isimli kitapları yazmıştır.

1988 yılında SONAR Araştırma şirketini kurmuştur. Süleyman Demirel ve Bülent Ecevit gibi yakın tarihimize malolmuş başbakanların profesyonel olarak danışmanlığını yapmıştır. Ayrıca Erdal İnönü, Alparslan Türkeş, Murat Karayalçın, Mesut Yılmaz ve Deniz Baykal için de benzer çalışmalar yapan Bayrakçı, 36 yıllık meslek hayatında 400’den fazla Belediye başkanı, 28 Bakan, 17 Parti Genel Başkanı ve 5 Başbakana da profesyonel olarak benzer danışmanlık hizmeti vermiştir.
1999 ve 2006 yılları arasında tarih programı sunan Hakan Bayrakçı, çeşitli televizyon programlarına da konuk yorumcu olarak katılmıştır.

Hakan Bayrakçı, Fransızca ve İngilizce bilmektedir. Profesyonel meslek hayatından kalan boş vakitlerinde hobi olarak, çok sesli müzik besteleri ve resim yapmaktadır. Hobileri arasında, sanat tarihi, piyano çalmak, klasik türk ve batı müziği dinlemek, felsefe ve sosyoloji bulunmaktadır.

İstanbul’da yaşayan Hakan Bayrakçı muhtelif dernek ve vakıflarda da yöneticilik yapmaktadır.